Ouverture du PALEOLAB sur le site des C¨¦zeaux : fouiller le pass¨¦ pour pr¨¦dire l¡¯avenir de l¡¯agriculture !
Un laboratoire d¨¦di¨¦ ¨¤ l¡¯analyse de l¡¯ADN ancien¨C technique scientifique appel¨¦e pal¨¦og¨¦nomique, a vu le jour sur le site des C¨¦zeaux d¡¯INRAE Clermont-Auvergne-Rh?ne-Alpes, et a ¨¦t¨¦ inaugur¨¦ le 24 mars en pr¨¦sence des partenaires et financeurs : le PALEOLAB.
Ce dispositif permet d¡¯analyser le patrimoine g¨¦n¨¦tique de restes arch¨¦obotaniques et de fournir des instantan¨¦s des ¨¦tats g¨¦n¨¦tiques pass¨¦s qui, compar¨¦s ¨¤ la diversit¨¦ moderne, permettent de mieux comprendre l¡¯adaptation des esp¨¨ces et ainsi de reconstruire l'histoire de l¡¯agriculture. Pour mener ¨¤ bien ces ¨¦tudes, une collaboration renforc¨¦e INRAE-Inrap a ¨¦t¨¦ conclue : fouiller le pass¨¦ pour pr¨¦dire l¡¯avenir !
Le s¨¦quen?age d'ADN de restes arch¨¦obotaniques de nos plantes cultiv¨¦es modernes, fournit des instantan¨¦s du pass¨¦ qui, compar¨¦s ¨¤ la diversit¨¦ g¨¦n¨¦tique actuelle, permet de mieux comprendre l¡¯histoire de l¡¯agriculture en tant que processus majeur dans la structuration socio-¨¦conomique des civilisations et communaut¨¦s humaines.
Dans le cadre d¡¯un financement FEDER- R¨¦gion Auvergne Rh?ne-Alpes et ANR le PALEOLAB est d¨¦sormais d¨¦di¨¦ ¨¤ ces activit¨¦s et constitue un outil ouvert aux chercheurs pour r¨¦pondre aux questions de recherche suivantes : quel est le centre de domestication des plantes cultiv¨¦s modernes? Comment ces esp¨¨ces se sont adapt¨¦es aux contraintes environnementales pass¨¦es ? Comment l¡¯histoire de l¡¯agriculture nous renseigne sur l¡¯histoire des populations humaines ?
Une collaboration INRAE-Inrap au c?ur de l¡¯activit¨¦ du PALEOLAB
Les donn¨¦es de pal¨¦og¨¦nomique, d¡¯arch¨¦obotanique, d¡¯arch¨¦ologie et de climatologie d¨¦livr¨¦es par les sites de fouilles permettent de caract¨¦riser quelle diversit¨¦ g¨¦n¨¦tique ¨¦tait cultiv¨¦e, de quels g¨¦notypes modernes ils sont proches et ainsi de reconstruire l'histoire de l¡¯agriculture pour retracer les voies de contacts, de migrations ou d'¨¦changes entre population humaines en Europe durant l¡¯Holoc¨¨ne.
La pal¨¦og¨¦nomique est le c?ur de l¡¯activit¨¦ du PALEOLAB. Le d¨¦veloppement de l¡¯activit¨¦ n¨¦cessite la mise en ?uvre de techniques, de technologies et de conditions de traitement des ¨¦chantillons sp¨¦cifiques ¨¤ l¡¯ADN ancien. Pour cela, les diff¨¦rentes ¨¦tapes seront r¨¦alis¨¦es au sein du laboratoire, port¨¦ par l¡¯UMR G¨¦n¨¦tique Diversit¨¦ et Ecophysiologie des c¨¦r¨¦ales (UMR INRAE ¨C UCA GDEC), qui permet la manipulation des ¨¦chantillons arch¨¦obotaniques, notamment fourni par l¡¯Inrap, sans risque de contaminations ext¨¦rieures (laboratoires pr¨¦sentant des cascades de pressurisation de l¡¯air) pour :
- le tamisage des ¨¦chantillons en structure confin¨¦e ;
- l¡¯identification pr¨¦cise de tous les ¨¦chantillons (esp¨¨ces, tissus) et la prise d¡¯images au laboratoire de ? carpologie ? en surpression de niveau II ;
- le broyage et extraction de l¡¯ADN au laboratoire confin¨¦ ? aDNA ? en surpression de niveau I ;
- la pr¨¦paration pour le s¨¦quen?age au laboratoire de ? biologie mol¨¦culaire ? en d¨¦pression de niveau II ;
- l¡¯analyse bioinformatique des s¨¦quences produites.
Ce laboratoire dispose de toutes les composantes utiles pour mener ¨¤ bien les activit¨¦s de pal¨¦og¨¦nomique : une salle de tamisage confin¨¦e, une salle d¡¯identification des ¨¦chantillons, une salle confin¨¦e d'extraction d'ADN, une chambre de stockage du mat¨¦riel arch¨¦ologique, un laboratoire de biologie mol¨¦culaire et d¡¯analyses bio-informatique... Ce laboratoire assure ainsi l¡¯¨¦limination de toute forme de contamination pour l¡¯exploitation optimale des ¨¦chantillons anciens. Cette structure est ouverte ¨¤ l¡¯ensemble des chercheurs souhaitant mener des travaux de paleog¨¦nomique par l¡¯analyse de l¡¯ADN ancien sur leurs esp¨¨ces d¡¯int¨¦r¨ºt.