Microbiologie Environnement Digestif Sant¨¦
UMR 0454 / UCA
- Adresse :
- INRAE Site de Theix
, INRAE - Clermont Auvergne Rh?ne Alpes
63122 SAINT-GENES-CHAMPANELLE
- T¨¦l :
- 04-73-17-83-08
- Sur Internet :
- www6.ara.inrae.fr/medis/
- Adresse :
- CBRV
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-PT招财进宝
- T¨¦l :
- 04-73-17-83-08
- Sur Internet :
- www6.ara.inrae.fr/medis/
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Mickael DESVAUX
- Directrice Adjointe
- Stephanie BLANQUET DIOT
Composition ¨¦quipe ( effectif total : 54 )
- BEYSSAC Erick -
- BLANQUET DIOT Stephanie -
- ETIENNE MESMIN Lucie -
- GARRAIT Ghislain -
- LAINE Emmanuelle -
- PEYRET Pierre -
- BERNALIER DONADILLE Annick -
- DESVAUX Mickael -
- FORANO Evelyne -
- HEBRAUD Michel -
- JUBELIN Gregory -
- MOSONI Pascale -
- SAPOUNTZIS Panagiotis -
- TALON Regine -
- DEL HOMME Christophe -
- DENIS Sylvain -
- DUNIERE Lysiane -
- DURAND Frederique -
- FADHLAOUI Khaled -
- LEROY Sabine -
- BLANCHOT Amelie -
- CHAFSEY Ingrid -
- CHALANCON Sandrine -
- DURIF Claude -
- GUILLOT Laurie -
- RUIZ Philippe -
- ANDANT Carine -
- CACCIA Nelly -
- CISSOIRE Arlette -
- DANIEL Julien -
- DANON Jeanne -
- DE MARTRIN Christophe -
- DELMAS Eve -
- DESCHAMPS Charlotte -
- DHAINAUT Catherine -
- DO COUTO Maria Gloria -
- DURAND Alexandra -
- DUTILLOY Stephanie -
- FURELAU MEYNIER Louise -
- GARRIVIER Annie -
- LALLIER Nathalie -
- LEBBAOUI Yacine -
- MAZAL Carine -
- MILESI Sylvie -
- RADECKI Floriane -
- RICHARD Alexandre -
- ROUSSEAU Valerie -
- BELTRAMO Chloe -
- BRON Auriane -
- FAKIH Ibrahim -
- GUILBAUD Justine -
- LEFEVRE Helene -
- O'SULLIVAN Deborah -
- BOUVARD Perrine -
Th¨¨mes de Recherche
L¡¯Unit¨¦ MEDiS (Microbiologie Environnement Digestif et Sant¨¦ ; https://www6.ara.inrae.fr/medis/), est une Unit¨¦ Mixte de Recherche entre INRAE (Institut National de Recherche pour l¡¯Agriculture, l¡¯Alimentation et l¡¯Environnement) et l'UCA (Universit¨¦ Clermont Auvergne) cr¨¦¨¦e en Janvier 2017. L'UMR454 MEDiS est g¨¦ographiquement localis¨¦e sur deux sites, le site de Theix (Centre de Recherche Clermont-Auvergne-Rh?ne-Alpes, 63122 Saint-Gen¨¨s Champanelle) et le site Dunant (Facult¨¦ de M¨¦decine et de Parapharmacie, 63000 Clermont-Ferrand).
L'Unit¨¦ MEDiS est organis¨¦e en mono-¨¦quipe et s'articule autour de quatre axes th¨¦matiques de recherche interactifs : (i) Pathog¨¨nes Alimentaires Zoonotiques (PAZ), avec l'¨¦tude de l'¨¦cophysiologie des Escherichia coli pathog¨¨nes diarrh¨¦iques (DEC), et plus g¨¦n¨¦ralement du colibiome et du microbiome associ¨¦, ainsi que de listeria monocytogenes, (ii) Fonctions M¨¦taboliques du Microbiote digestif et Dysbioses (FM2D), en particulier avec l'¨¦tude d'intrants positifs ou n¨¦gatifs comme les polyph¨¦nols et les x¨¦nobiotiques, dans des situations physiologiques ou pathologiques (syndrome de l'intestin irritable et ob¨¦sit¨¦), (iii) GAL¨¦niques INNovantes (GALINN) avec le d¨¦veloppement de nouvelles strat¨¦gies de vectorisation de probiotiques, de pr¨¦biotiques ou de substances actives et (iv) INNOvations et d¨¦veloppement de mod¨¨les in VITRO (INNOVITRO) avec le d¨¦veloppement de syst¨¨mes digestifs artificiels ou de syst¨¨mes de capture de g¨¨nes.
Les recherches de l'Unit¨¦ portent sur l'¨¦tude des interactions des microbiotes alimentaires et digestifs de l'animal et de l'Homme avec leur environnement. L'objectif principal des travaux conduits au sein de l'UMR vise ¨¤ ¨¦tudier les inter-relations entre micro-organismes intestinaux et alimentation, facteurs environnementaux et/ou agents pathog¨¨nes pouvant conduire ¨¤ diff¨¦rentes situations physio-pathologiques. Il s'agit ¨¦galement de pouvoir proposer des strat¨¦gies innovantes permettant de traiter/pr¨¦venir les d¨¦sordres microbiens impliqu¨¦s dans les ¨¦tats pathologiques ¨¦tudi¨¦s. Le microbiote est ainsi le point central commun aux diff¨¦rents axes de recherche.
L'Unit¨¦ dispose d'infrastructures exp¨¦rimentales performantes avec 4 plateaux techniques ; l'Installation Exp¨¦rimentale Microbiologie (IEM) INRAE, mettant ¨¤ disposition une animalerie gnotobiotique, le plateau UCA Partner GALBIOPHARM d¨¦di¨¦ ¨¤ l'¨¦valuation biopharmaceutique et gal¨¦nique de compos¨¦s actifs, le plateau UCA Partner DIGESTIV de simulation de l'environnement digestif humain et animal, le plateau UCA Partner CAPTURE d¨¦di¨¦ ¨¤ la capture de g¨¨nes. L'Unit¨¦ a des liens privil¨¦gi¨¦s avec des plateformes r¨¦gionales dans lesquelles des scientifiques du MEDiS ont des responsabilit¨¦s, la plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi), la plateforme d'exploration du m¨¦tabolisme (PFEM) et la plateforme IRICE PRIMUM (plateforme de recherche int¨¦grative en nutrition et mobilit¨¦).
L'UMR MEDiS repr¨¦sente un effectif d'environ 70 personnes dont une quarantaine de titulaires INRAE ou UCA (Directeur de Recheche, Professeur d'Universit¨¦, Charg¨¦ de Recherche, Ma?tre de Conf¨¦rence Universitaire, Ing¨¦nieur de Recherche, Ing¨¦nieur d'Etude, Assistant Ing¨¦nieur, Technicien de Recherche, Adjoint Technique Principal). Elle accueille r¨¦guli¨¨rement des doctorants et post-doctorants ainsi que des stagiaires et CDD, repr¨¦sentant en moyenne une quinzaine de contractuels par an. MEDiS accueille et collabore avec des personnels d¨¦tach¨¦s de la soci¨¦t¨¦ Lallemand, en particulier son Unit¨¦ d'Affaires Nutrition Animale, avec qui elle d¨¦veloppe depuis plus de 25 ans un partenariat de recherche privil¨¦gi¨¦ concernant l'utilisation d'additifs alimentaires pour les animaux d'¨¦levage en lien avec les th¨¨mes FM2D et PAZ.
Publications ( HAL )
- Enterobacteriaceae in the Human Gut: Dynamics and Ecological Roles in Health and Disease
Maria Ines Moreira de Gouveia , Annick Bernalier-Donadille , Gregory Jubelin - Molecular detection of Listeria monocytogenes from different dairy and street food sources in North Karnataka, India
Roshan Kumar Sharma , Sunil Jalalpure , Swati Pathak , Sachit Ganapathy , Micka?l Desvaux , Subarna Roy , Satisha Hegde - Activity of Epsilon-poly-L-lysine against Multidrug-Resistant Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella pneumoniae Isolates of Urinary Tract Infections
Telma de Sousa , Carolina Saben?a , Miguel Ribeiro , Mario Pino-Hurtado , Carmen Torres , Michel H¨¦braud , Olimpia Alves , Sara Sousa , Eliana Costa , Gilberto Igrejas , Patr¨ªcia Poeta - Canine Mucosal Artificial Colon: development of a new colonic in vitro model adapted to dog sizes
Charlotte Deschamps , Sylvain Denis , Delphine Humbert , Nathalie Priymenko , Sandrine Chalancon , Jana de Bodt , Tom van de Wiele , Ignacio Ipharraguerre , Inma Alvarez-Acero , Caroline Achard , Emmanuelle Apper , St¨¦phanie Blanquet-Diot - Applying targeted gene hybridization capture to viruses with a focus to SARS-CoV-2
Andres Ceballos-Garzon , Sophie Comtet-Marre , Pierre Peyret - Casein structures differently affect postprandial amino acid delivery through their intra-gastric clotting properties
Audrey Boulier , Sylvain Denis , Gw¨¦na?le Henry , Sylvie Guerin , Monique Alric , Nathalie Meunier , Adeline Blot , Bruno Pereira , Corinne Malpuech-Brugere , Didier Remond , Yves Boirie , Alain Baniel , Ruddy Richard , Didier Dupont , Ga?lle Boudry - Large intestinal nutritional and physicochemical parameters from different dog sizes reshape canine microbiota structure and functions in vitro
Charlotte Deschamps , Delphine Humbert , Sandrine Chalancon , Caroline Achard , Emmanuelle Apper , Sylvain Denis , St¨¦phanie Blanquet-Diot - Impact of Dietary Regime and Seasonality on Hindgut¡¯s Mycobiota Diversity in Dairy Cows
Ali Sadek , Bernard Taminiau , Georges Daube , Panagiotis Sapountzis , Fr¨¦d¨¦rique Chaucheyras-Durand , Mathieu Castex , Fran?oise Coucheney , Djamel Drider - Development of a new antibiotic-induced dysbiosis model of the canine colonic microbiota
Charlotte Deschamps , Emmanuelle Apper , Morgane Brun , Claude Durif , Sylvain Denis , Delphine Humbert , St¨¦phanie Blanquet-Diot - Proteomic identification of novel adhesins in enterohaemorrhagic Escherichia coli 0157 -- H7 in a strategy of preventing intestinal colonization
Ricardo Monteiro
Production scientifique depuis 2020
- Forme gal¨¦nique ¨¤ base de pulpe de baobab, proc¨¦d¨¦s de pr¨¦paration et utilisations - 2021
- Mod¨¨le dynamique d'¨¦tude in vitro de la perm¨¦abilit¨¦ intestinale d'une mol¨¦cule d'int¨¦r¨ºt coupl¨¦ en continu ¨¤ un dispositif de dissolution ou de digestion - 2022
- Proc¨¦d¨¦ de d¨¦tection d'une pathologie - 2023